Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KIF5AQ12840 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms