Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FMODQ06828 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FMODQ06828 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FMODQ06828 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FMODQ06828 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FMODQ06828 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FMODQ06828 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FMODQ06828 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FMODQ06828 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FMODQ06828 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FMODQ06828 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FMODQ06828 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FMODQ06828 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FMODQ06828 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FMODQ06828 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FMODQ06828 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FMODQ06828 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FMODQ06828 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FMODQ06828 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FMODQ06828 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FMODQ06828 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FMODQ06828 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FMODQ06828 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FMODQ06828 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FMODQ06828 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FMODQ06828 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FMODQ06828 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FMODQ06828 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FMODQ06828 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FMODQ06828 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FMODQ06828 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FMODQ06828 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FMODQ06828 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FMODQ06828 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FMODQ06828 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FMODQ06828 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FMODQ06828 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FMODQ06828 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FMODQ06828 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FMODQ06828 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FMODQ06828 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FMODQ06828 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FMODQ06828 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FMODQ06828 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FMODQ06828 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FMODQ06828 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FMODQ06828 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FMODQ06828 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FMODQ06828 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FMODQ06828 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FMODQ06828 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FMODQ06828 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FMODQ06828 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FMODQ06828 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FMODQ06828 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FMODQ06828 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FMODQ06828 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FMODQ06828 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FMODQ06828 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FMODQ06828 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FMODQ06828 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FMODQ06828 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FMODQ06828 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FMODQ06828 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FMODQ06828 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FMODQ06828 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FMODQ06828 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FMODQ06828 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FMODQ06828 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FMODQ06828 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FMODQ06828 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FMODQ06828 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FMODQ06828 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FMODQ06828 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FMODQ06828 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FMODQ06828 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FMODQ06828 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FMODQ06828 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FMODQ06828 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FMODQ06828 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FMODQ06828 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FMODQ06828 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FMODQ06828 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FMODQ06828 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FMODQ06828 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FMODQ06828 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FMODQ06828 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FMODQ06828 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FMODQ06828 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FMODQ06828 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FMODQ06828 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FMODQ06828 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FMODQ06828 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FMODQ06828 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FMODQ06828 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FMODQ06828 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FMODQ06828 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FMODQ06828 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FMODQ06828 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FMODQ06828 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms