Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms