Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms