Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms