Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACVR1Q04771 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms