Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIM1P81133 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIM1P81133 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIM1P81133 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIM1P81133 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIM1P81133 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIM1P81133 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIM1P81133 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIM1P81133 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SIM1P81133 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIM1P81133 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SIM1P81133 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIM1P81133 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIM1P81133 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIM1P81133 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIM1P81133 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIM1P81133 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIM1P81133 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIM1P81133 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIM1P81133 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIM1P81133 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIM1P81133 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIM1P81133 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SIM1P81133 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIM1P81133 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIM1P81133 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SIM1P81133 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIM1P81133 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIM1P81133 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIM1P81133 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIM1P81133 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIM1P81133 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIM1P81133 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIM1P81133 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIM1P81133 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIM1P81133 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIM1P81133 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIM1P81133 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIM1P81133 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIM1P81133 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIM1P81133 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIM1P81133 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIM1P81133 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIM1P81133 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SIM1P81133 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIM1P81133 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIM1P81133 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIM1P81133 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms