Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPCS3P61009 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms