Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP107P57740 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP107P57740 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP107P57740 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP107P57740 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP107P57740 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP107P57740 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP107P57740 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP107P57740 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP107P57740 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP107P57740 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP107P57740 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP107P57740 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP107P57740 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP107P57740 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP107P57740 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP107P57740 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP107P57740 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP107P57740 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms