Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BACE1P56817 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BACE1P56817 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BACE1P56817 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BACE1P56817 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BACE1P56817 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BACE1P56817 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BACE1P56817 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BACE1P56817 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BACE1P56817 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BACE1P56817 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BACE1P56817 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BACE1P56817 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BACE1P56817 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BACE1P56817 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BACE1P56817 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BACE1P56817 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BACE1P56817 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BACE1P56817 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BACE1P56817 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BACE1P56817 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BACE1P56817 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BACE1P56817 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BACE1P56817 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BACE1P56817 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BACE1P56817 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BACE1P56817 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BACE1P56817 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BACE1P56817 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BACE1P56817 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BACE1P56817 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BACE1P56817 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BACE1P56817 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BACE1P56817 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BACE1P56817 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BACE1P56817 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BACE1P56817 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BACE1P56817 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BACE1P56817 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BACE1P56817 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BACE1P56817 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BACE1P56817 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BACE1P56817 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BACE1P56817 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BACE1P56817 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BACE1P56817 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms