Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MTTPP55157 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MTTPP55157 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MTTPP55157 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MTTPP55157 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTTPP55157 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTTPP55157 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTTPP55157 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTTPP55157 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTTPP55157 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTTPP55157 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTTPP55157 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTTPP55157 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MTTPP55157 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTTPP55157 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MTTPP55157 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTTPP55157 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MTTPP55157 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTTPP55157 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTTPP55157 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTTPP55157 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MTTPP55157 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTTPP55157 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MTTPP55157 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTTPP55157 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTTPP55157 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTTPP55157 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTTPP55157 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTTPP55157 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTTPP55157 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTTPP55157 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTTPP55157 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTTPP55157 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTTPP55157 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTTPP55157 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTTPP55157 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTTPP55157 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTTPP55157 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTTPP55157 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTTPP55157 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTTPP55157 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms