Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA4P51532 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms