Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGCXP38435 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGCXP38435 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGCXP38435 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGCXP38435 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGCXP38435 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGCXP38435 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGCXP38435 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGCXP38435 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGCXP38435 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGCXP38435 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGCXP38435 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGCXP38435 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGCXP38435 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGCXP38435 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGCXP38435 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGCXP38435 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGCXP38435 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGCXP38435 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGCXP38435 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGCXP38435 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GGCXP38435 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGCXP38435 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGCXP38435 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGCXP38435 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGCXP38435 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGCXP38435 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGCXP38435 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GGCXP38435 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGCXP38435 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGCXP38435 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGCXP38435 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGCXP38435 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GGCXP38435 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGCXP38435 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGCXP38435 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGCXP38435 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GGCXP38435 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGCXP38435 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGCXP38435 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGCXP38435 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGCXP38435 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGCXP38435 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGCXP38435 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGCXP38435 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGCXP38435 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGCXP38435 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGCXP38435 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGCXP38435 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGCXP38435 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGCXP38435 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GGCXP38435 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGCXP38435 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGCXP38435 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGCXP38435 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGCXP38435 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGCXP38435 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGCXP38435 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGCXP38435 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGCXP38435 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGCXP38435 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGCXP38435 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGCXP38435 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GGCXP38435 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGCXP38435 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GGCXP38435 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GGCXP38435 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGCXP38435 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGCXP38435 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGCXP38435 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGCXP38435 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGCXP38435 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGCXP38435 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGCXP38435 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GGCXP38435 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GGCXP38435 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GGCXP38435 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GGCXP38435 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GGCXP38435 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GGCXP38435 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
GGCXP38435 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GGCXP38435 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GGCXP38435 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GGCXP38435 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GGCXP38435 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGCXP38435 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGCXP38435 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGCXP38435 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGCXP38435 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGCXP38435 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGCXP38435 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GGCXP38435 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGCXP38435 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGCXP38435 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGCXP38435 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGCXP38435 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGCXP38435 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGCXP38435 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGCXP38435 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GGCXP38435 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms