Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGP37231 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGP37231 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGP37231 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGP37231 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms