Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FLT4P35916 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FLT4P35916 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FLT4P35916 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FLT4P35916 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FLT4P35916 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FLT4P35916 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FLT4P35916 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FLT4P35916 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FLT4P35916 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FLT4P35916 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FLT4P35916 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FLT4P35916 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FLT4P35916 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FLT4P35916 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FLT4P35916 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FLT4P35916 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FLT4P35916 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FLT4P35916 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FLT4P35916 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FLT4P35916 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FLT4P35916 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FLT4P35916 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FLT4P35916 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FLT4P35916 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FLT4P35916 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FLT4P35916 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FLT4P35916 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FLT4P35916 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FLT4P35916 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FLT4P35916 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FLT4P35916 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FLT4P35916 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FLT4P35916 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FLT4P35916 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FLT4P35916 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FLT4P35916 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FLT4P35916 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FLT4P35916 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FLT4P35916 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FLT4P35916 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FLT4P35916 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FLT4P35916 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FLT4P35916 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FLT4P35916 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FLT4P35916 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FLT4P35916 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FLT4P35916 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FLT4P35916 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FLT4P35916 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FLT4P35916 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FLT4P35916 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FLT4P35916 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FLT4P35916 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FLT4P35916 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FLT4P35916 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FLT4P35916 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FLT4P35916 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FLT4P35916 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FLT4P35916 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FLT4P35916 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FLT4P35916 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FLT4P35916 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FLT4P35916 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FLT4P35916 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FLT4P35916 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FLT4P35916 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FLT4P35916 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FLT4P35916 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FLT4P35916 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FLT4P35916 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FLT4P35916 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FLT4P35916 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FLT4P35916 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FLT4P35916 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FLT4P35916 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FLT4P35916 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FLT4P35916 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FLT4P35916 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FLT4P35916 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FLT4P35916 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FLT4P35916 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FLT4P35916 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FLT4P35916 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FLT4P35916 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FLT4P35916 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FLT4P35916 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FLT4P35916 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FLT4P35916 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FLT4P35916 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FLT4P35916 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FLT4P35916 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FLT4P35916 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FLT4P35916 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FLT4P35916 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FLT4P35916 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FLT4P35916 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FLT4P35916 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FLT4P35916 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FLT4P35916 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms