Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms