Protein–RNA interactions for Protein: P34981

TRHR, Thyrotropin-releasing hormone receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHRP34981 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRHRP34981 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRHRP34981 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRHRP34981 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRHRP34981 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRHRP34981 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRHRP34981 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRHRP34981 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRHRP34981 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRHRP34981 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRHRP34981 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRHRP34981 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRHRP34981 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRHRP34981 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRHRP34981 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRHRP34981 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRHRP34981 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRHRP34981 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRHRP34981 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRHRP34981 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRHRP34981 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRHRP34981 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRHRP34981 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRHRP34981 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRHRP34981 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRHRP34981 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRHRP34981 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRHRP34981 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRHRP34981 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRHRP34981 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRHRP34981 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRHRP34981 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRHRP34981 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRHRP34981 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRHRP34981 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRHRP34981 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRHRP34981 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRHRP34981 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRHRP34981 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRHRP34981 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRHRP34981 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRHRP34981 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRHRP34981 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRHRP34981 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRHRP34981 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRHRP34981 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRHRP34981 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRHRP34981 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRHRP34981 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRHRP34981 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRHRP34981 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRHRP34981 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms