Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP1P29466 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP1P29466 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP1P29466 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP1P29466 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP1P29466 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP1P29466 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP1P29466 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP1P29466 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP1P29466 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP1P29466 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP1P29466 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP1P29466 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP1P29466 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP1P29466 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP1P29466 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP1P29466 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP1P29466 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP1P29466 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP1P29466 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP1P29466 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP1P29466 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP1P29466 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP1P29466 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP1P29466 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP1P29466 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP1P29466 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP1P29466 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP1P29466 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP1P29466 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP1P29466 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP1P29466 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP1P29466 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP1P29466 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP1P29466 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP1P29466 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP1P29466 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP1P29466 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP1P29466 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP1P29466 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP1P29466 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP1P29466 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP1P29466 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP1P29466 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP1P29466 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP1P29466 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP1P29466 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP1P29466 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP1P29466 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP1P29466 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP1P29466 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP1P29466 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP1P29466 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP1P29466 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms