Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms