Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms