Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms