Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CXCL3P19876 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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