Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
XBP1P17861 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
XBP1P17861 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
XBP1P17861 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
XBP1P17861 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
XBP1P17861 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
XBP1P17861 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
XBP1P17861 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
XBP1P17861 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
XBP1P17861 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
XBP1P17861 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
XBP1P17861 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
XBP1P17861 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
XBP1P17861 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
XBP1P17861 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
XBP1P17861 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
XBP1P17861 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
XBP1P17861 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
XBP1P17861 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
XBP1P17861 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
XBP1P17861 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
XBP1P17861 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
XBP1P17861 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
XBP1P17861 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
XBP1P17861 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
XBP1P17861 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
XBP1P17861 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
XBP1P17861 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
XBP1P17861 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
XBP1P17861 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XBP1P17861 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XBP1P17861 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XBP1P17861 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XBP1P17861 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XBP1P17861 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XBP1P17861 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XBP1P17861 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XBP1P17861 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XBP1P17861 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XBP1P17861 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XBP1P17861 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XBP1P17861 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XBP1P17861 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XBP1P17861 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XBP1P17861 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XBP1P17861 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XBP1P17861 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XBP1P17861 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XBP1P17861 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
XBP1P17861 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XBP1P17861 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XBP1P17861 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XBP1P17861 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XBP1P17861 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
XBP1P17861 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XBP1P17861 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XBP1P17861 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XBP1P17861 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XBP1P17861 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XBP1P17861 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XBP1P17861 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XBP1P17861 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XBP1P17861 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XBP1P17861 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
XBP1P17861 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XBP1P17861 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XBP1P17861 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XBP1P17861 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XBP1P17861 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
XBP1P17861 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XBP1P17861 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XBP1P17861 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XBP1P17861 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XBP1P17861 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XBP1P17861 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XBP1P17861 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XBP1P17861 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XBP1P17861 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XBP1P17861 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XBP1P17861 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XBP1P17861 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XBP1P17861 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XBP1P17861 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XBP1P17861 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XBP1P17861 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XBP1P17861 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XBP1P17861 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XBP1P17861 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XBP1P17861 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XBP1P17861 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XBP1P17861 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XBP1P17861 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XBP1P17861 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XBP1P17861 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XBP1P17861 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XBP1P17861 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XBP1P17861 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XBP1P17861 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XBP1P17861 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XBP1P17861 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms