Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms