Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRF1P14222 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRF1P14222 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PRF1P14222 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRF1P14222 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRF1P14222 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRF1P14222 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRF1P14222 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRF1P14222 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRF1P14222 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRF1P14222 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRF1P14222 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRF1P14222 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRF1P14222 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRF1P14222 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRF1P14222 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRF1P14222 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRF1P14222 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PRF1P14222 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRF1P14222 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRF1P14222 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRF1P14222 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRF1P14222 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRF1P14222 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRF1P14222 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRF1P14222 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRF1P14222 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRF1P14222 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRF1P14222 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRF1P14222 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRF1P14222 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRF1P14222 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRF1P14222 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRF1P14222 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRF1P14222 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRF1P14222 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRF1P14222 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRF1P14222 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRF1P14222 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRF1P14222 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PRF1P14222 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRF1P14222 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRF1P14222 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRF1P14222 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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