Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH1P12830 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH1P12830 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms