Protein–RNA interactions for Protein: P10398

ARAF, Serine/threonine-protein kinase A-Raf, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAFP10398 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARAFP10398 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARAFP10398 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARAFP10398 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARAFP10398 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARAFP10398 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARAFP10398 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARAFP10398 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARAFP10398 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARAFP10398 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARAFP10398 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARAFP10398 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARAFP10398 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARAFP10398 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARAFP10398 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARAFP10398 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms