Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI2P10070 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI2P10070 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI2P10070 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GLI2P10070 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GLI2P10070 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GLI2P10070 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GLI2P10070 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GLI2P10070 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GLI2P10070 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI2P10070 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI2P10070 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI2P10070 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI2P10070 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI2P10070 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI2P10070 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI2P10070 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI2P10070 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI2P10070 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI2P10070 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI2P10070 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI2P10070 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI2P10070 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI2P10070 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI2P10070 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI2P10070 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI2P10070 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI2P10070 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI2P10070 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI2P10070 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI2P10070 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI2P10070 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI2P10070 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI2P10070 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI2P10070 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI2P10070 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI2P10070 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI2P10070 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI2P10070 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI2P10070 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI2P10070 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI2P10070 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI2P10070 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI2P10070 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI2P10070 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI2P10070 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI2P10070 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI2P10070 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI2P10070 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI2P10070 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI2P10070 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI2P10070 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI2P10070 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI2P10070 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI2P10070 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI2P10070 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI2P10070 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI2P10070 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI2P10070 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI2P10070 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI2P10070 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI2P10070 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI2P10070 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI2P10070 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI2P10070 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI2P10070 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI2P10070 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI2P10070 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI2P10070 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI2P10070 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI2P10070 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI2P10070 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI2P10070 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI2P10070 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI2P10070 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI2P10070 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI2P10070 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI2P10070 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI2P10070 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI2P10070 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI2P10070 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI2P10070 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI2P10070 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI2P10070 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI2P10070 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI2P10070 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI2P10070 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI2P10070 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI2P10070 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI2P10070 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI2P10070 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI2P10070 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI2P10070 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI2P10070 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI2P10070 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI2P10070 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI2P10070 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI2P10070 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI2P10070 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI2P10070 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms