Protein–RNA interactions for Protein: O94900

TOX, Thymocyte selection-associated high mobility group box protein TOX, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOXO94900 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOXO94900 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOXO94900 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOXO94900 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOXO94900 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOXO94900 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOXO94900 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOXO94900 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOXO94900 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOXO94900 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOXO94900 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOXO94900 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOXO94900 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOXO94900 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOXO94900 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOXO94900 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOXO94900 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOXO94900 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOXO94900 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOXO94900 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOXO94900 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOXO94900 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOXO94900 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TOXO94900 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TOXO94900 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOXO94900 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOXO94900 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOXO94900 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOXO94900 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOXO94900 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOXO94900 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOXO94900 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOXO94900 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOXO94900 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOXO94900 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TOXO94900 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TOXO94900 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TOXO94900 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TOXO94900 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TOXO94900 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TOXO94900 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TOXO94900 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TOXO94900 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TOXO94900 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TOXO94900 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TOXO94900 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TOXO94900 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TOXO94900 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TOXO94900 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms