Protein–RNA interactions for Protein: O43556

SGCE, Epsilon-sarcoglycan, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCEO43556 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SGCEO43556 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SGCEO43556 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCEO43556 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCEO43556 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SGCEO43556 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCEO43556 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SGCEO43556 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SGCEO43556 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SGCEO43556 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SGCEO43556 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SGCEO43556 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SGCEO43556 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SGCEO43556 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCEO43556 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCEO43556 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCEO43556 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCEO43556 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCEO43556 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCEO43556 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCEO43556 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCEO43556 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCEO43556 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCEO43556 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCEO43556 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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