Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBDO15205 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBDO15205 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBDO15205 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBDO15205 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBDO15205 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBDO15205 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBDO15205 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBDO15205 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBDO15205 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBDO15205 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBDO15205 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBDO15205 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBDO15205 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBDO15205 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBDO15205 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBDO15205 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBDO15205 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBDO15205 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBDO15205 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBDO15205 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBDO15205 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBDO15205 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBDO15205 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBDO15205 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBDO15205 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBDO15205 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBDO15205 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBDO15205 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
UBDO15205 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBDO15205 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBDO15205 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBDO15205 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBDO15205 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBDO15205 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBDO15205 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBDO15205 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBDO15205 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBDO15205 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBDO15205 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBDO15205 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBDO15205 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBDO15205 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBDO15205 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBDO15205 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBDO15205 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBDO15205 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBDO15205 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBDO15205 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBDO15205 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBDO15205 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBDO15205 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBDO15205 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBDO15205 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms