Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms