Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms