Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC162PA2VCL2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms