Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms