Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HIF3AQ9Y2N7 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HIF3AQ9Y2N7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HIF3AQ9Y2N7 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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