Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms