Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TMCC3Q9ULS5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TMCC3Q9ULS5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TMCC3Q9ULS5 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TMCC3Q9ULS5 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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