Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms