Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MLH3Q9UHC1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms