Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFDP1Q9UEE9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 288.9 ms