Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms