Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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