Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms