Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CENPMQ9NSP4 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CENPMQ9NSP4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CENPMQ9NSP4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CENPMQ9NSP4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CENPMQ9NSP4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CENPMQ9NSP4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CENPMQ9NSP4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CENPMQ9NSP4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CENPMQ9NSP4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CENPMQ9NSP4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CENPMQ9NSP4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CENPMQ9NSP4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CENPMQ9NSP4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CENPMQ9NSP4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CENPMQ9NSP4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CENPMQ9NSP4 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CENPMQ9NSP4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CENPMQ9NSP4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CENPMQ9NSP4 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CENPMQ9NSP4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CENPMQ9NSP4 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CENPMQ9NSP4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CENPMQ9NSP4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CENPMQ9NSP4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms