Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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