Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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