Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ROPN1BQ9BZX4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ROPN1BQ9BZX4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ROPN1BQ9BZX4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ROPN1BQ9BZX4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ROPN1BQ9BZX4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ROPN1BQ9BZX4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms