Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms