Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SSBP4Q9BWG4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms